世界各国の人口当たりCOVID-19患者数/死者数推移を可視化した(追記有)

　タイトル通りですが、各国(や地域*1 )の人口当たりCOVID-19患者数と死者数を可視化しました。
　単に患者数や死者数を集計した場合、現在では人口の多いアメリカが突出しており、他国の比較がまともにできないグラフになります。
　このため、患者数や死者数を人口で割った値をプロットしました。GIFではサイズが大きいのでYoutubeにアップロードしています。
　
(2020/4/20追記ここから)

各国の人口1万人辺りのCOVID-19患者数推移(2020-04-18時点)

各国の人口1万人辺りのCOVID-19患者数推移(2020-04-18時点)
※スケールの最小値(灰色)は0.01で固定ですが、最大値(赤色)はCOVID-19の蔓延に伴い経時的に値が大きくなっていることに注意してください。
　

各国の人口100万人辺りのCOVID-19死者数推移(2020-04-18時点)

各国の人口100万人辺りのCOVID-19死者数推移(2020-04-18時点)
※スケールの最小値(灰色)は0.01で固定ですが、最大値(赤色)はCOVID-19の蔓延に伴い経時的に値が大きくなっていることに注意してください。
　

データソース

EU open data portal: https://opendata.ecdc.europa.eu/covid19/casedistribution/csv

を集計してプロット

人口データは上記ファイルのpopData2018列*2を使用
各日までの各国の患者数(元ファイルではcases列)をサマリした値を人口で割った値を1万倍して人口1万人辺り患者数を算出
各日までの各国の死者数(元ファイルではdeaths列)をサマリした値を人口で割った値を100万倍して人口100万人辺り死者数を算出

(参考)生成に使った主要なソフトウェア

SQLite3
- EU open dataのCSVデータの集計に使用
Google Charts
- Map chartのプロットに使用
Google Chrome

HeadlessでGoogle Chartsのレンダリングに使用

Ubuntuで同様の作業を行う場合にはchromium-browserを使うのですが、今回はWindows(WSL)環境で作業しておりheadlessでもchromiumがコアダンプして使えませんでしたので、WSLからWindowsネイティブのchrome.exeをキックして使用

Chromium
- 処理の完全自動化に伴い、一連の処理をUbuntu Server環境に移設したためGoogle Chromeではなくchromium-browserをGoogle ChartsのレンダリングのためにHeadlessで使用
ImageMagick
- Headless ~~Chrome~~chromiumでレンダリングしたスクリーンショットを加工して映像の各フレームを生成
ffmpeg
- 映像のエンコードに使用
youtube-upload
- 生成した映像をYoutubeに投稿

　SQLiteで各日毎にサマッた値を吐き出して、Google Chartsを使ったHTMLを生成して、Headless ~~Chrome~~chromiumでレンダリング、ImageMagickで720p映像のフレーム画像に整形して、ffmpegでエンコードして映像化、youtube-uploadで投稿。この一連の流れを~~スクリプト叩くと~~cronで日次で実行されるようにしました。
　日本の各都道府県についても同様に可視化したかったのですが、Google Chartsが日本の都道府県単位での描画に対応していないことと、CSVのような機械処理できるフォーマットで都道府県別時系列データが公開されていないと思われるため、諦めました。